El primer número de la revista fue publicado en mayo de 1993 por la Fundación Huésped con el nombre Actualizaciones en sida. Se trató de la primera revista científica latinoamericana en idioma español que trataba específicamente la temática del VIH/sida destinada a profesionales de las áreas de Salud y Ciencias Sociales.

En marzo de 2013 se sumó la Sociedad Argentina de Infectología como institución coeditora para ampliar los contenidos hacia todos los aspectos relacionados a las enfermedades infecciosas. En ese momento, la revista adoptó su actual denominación, Actualizaciones en Sida e Infectología.